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标题：【题目+附件】2012年研究生数学建模竞赛试题A题
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所属分类: 数学建模 资源类型：文档 文件大小: 4.09 MB 上传时间: 2016-09-15 21:57:34 下载次数: 47 资源积分：1分 提 供 者: 数学建模编程 2012年研究生数学建模竞赛试题A题
内容：
基因识别问题及其算法实现
一、背景介绍
DNA是生物遗传信息的载体，其化学名称为脱氧核糖核酸（Deoxyribonucleic acid，缩写为DNA）。DNA分子是一种长链聚合物，DNA序列由腺嘌呤（Adenine, A），鸟嘌呤（Guanine, G），胞嘧啶（Cytosine, C），胸腺嘧啶（Thymine, T）这四种核苷酸（nucleotide）符号按一定的顺序连接而成。其中带有遗传讯息的DNA片段称为基因（Gene）（见图1第一行）。其他的DNA序列片段，有些直接以自身构造发挥作用，有些则参与调控遗传讯息的表现。
在真核生物的DNA序列中，基因通常被划分为许多间隔的片段（见图1第二行），其中编码蛋白质的部分，即编码序列（Coding Sequence）片段，称为外显子（Exon），不编码的部分称为内含子（Intron）。外显子在DNA序列剪接（Splicing）后仍然会被保存下来，并可在
 
蛋白质合成过程中被转录（tran ion）、复制（replication）而合成为蛋白质（见图2）。DNA序列通过遗传编码来储存信息，指导蛋白质的合成，把遗传信息准确无误地传递到蛋白质（protein）上去并实现各种生命功能。
 
对大量、复杂的基因序列的分析，传统生物学解决问题的方式是基于分子实验的方法，其代价高昂。诺贝尔奖获得者W.吉尔伯特（Walter Gilbert，1932—；【美】，第一个制备出混合脱氧核糖核酸的科学家）1991年曾经指出：“现在，基于全部基因序列都将知晓，并以电子可操作的方式驻留在数据库中，新的生物学研究模式的出发点应是理论的。一个科学家将从理论推测出发，然后再回到实验中去，追踪或验证这些理论假设。” 随着世界人类基因组工程计划的顺利完成，通过物理或数学的方法从大量的DNA序列中获取丰富的生物信息，对生物学、医学、药学等诸多方面都具有重要的理论意义和实际价值，也是目前生物信息学领域的一个研究热点。
 

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2012A基因识别问题及其算法实现/
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2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/A brief review of computational gene prediction methods.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/A new fourier transform approach for protein coding measure based on the format of the Z curve.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/Evaluation of DNA mapping schemes for exon detection（多种映射的识别正确率评价）.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/Frequency-domain analysis of biomolecular sequences.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/Gene prediction by spectral rotation measure a new method for identifying protein coding regions.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/Prediction of Complete Gene Structures in Human.PDF
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/Prediction of protein coding regions by the 3-base periodicity analysis of a DNA sequence.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/参考文献/REVIEW OF SIGNAL PROCESSING IN GENETICS.pdf
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/AB304259.1（酿酒酵母ATP1a，ATP1b，为F1F0- ATP酶复杂，完整的CD ATP1c基因）/AB304259.1.fasta
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/AB304259.1（酿酒酵母ATP1a，ATP1b，为F1F0- ATP酶复杂，完整的CD ATP1c基因）/AB304259.1_n.txt
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/AF100306.1(线虫粘粒T24C4，完整序列)/AF100306.1.fasta
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2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/CP002688.1(拟南芥染色体5，序列1-21000)/CP002688.1.fasta
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/CP002688.1(拟南芥染色体5，序列1-21000)/CP002688.1.txt
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/Genes100.mat
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2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/NC_012920_1(人线粒体全基因组)/NC_012920_1_cds.txt
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/genes200.mat
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因数据/genes6.mat
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/基因识别问题及其算法实现.doc
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/文本附件/附件1 其它数值映射.doc
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/文本附件/附件2 氨基酸与核苷酸密码子.doc
2012A基因识别问题及其算法实现/基因识别问题及其算法实现（9月15号稿）/文本附件/附件3：新闻：完整的“人类基因组DNA序列图”将产生.doc

关键词： 竞赛试题 数学建模 研究生

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